Стеклянные исторически появились раньше, они бьются при сильных ударах (падении) термоса. Металлические колбы прочнее, и соответственно такие термосы более предпочтительны. Единственный возможный недостаток: они склонны впитывать вкус продуктов (особенно крепкого чая), в отличие от стеклянных. Мыть может быть сложнее (но это ещё зависит от того, насколько качественно сделан термос)